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儀器設備

GenomeLab® GeXP遺傳分析系統(tǒng)

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隨著基因組學研究的深入, 人們逐漸從單純的遺傳多樣性研究轉(zhuǎn)向遺傳-環(huán)境關(guān)系研究,。單細胞分析為現(xiàn)今分子生物學研究的熱點,, 通過對單細胞的遺傳基因座水平的實時監(jiān)測可以更加準確地預測表型,。基因定量分析的傳統(tǒng)方法Q-PCR技術(shù)只能一次監(jiān)測1-3個基因,;GeXP系統(tǒng)采用創(chuàng)新的XP-PCR技術(shù),,在只有單個細胞的情況下配合Ampligrid擴增系統(tǒng),能夠?qū)Χ嘀?/span>30重的基因進行定量分析,, 是基因定量分析技術(shù)領(lǐng)域的突破性進展.北京市肝病研究所引進了該套設備,,歡迎合作。

一,、系統(tǒng)主要特點如下:

1.通量高: GeXP遺傳分析系統(tǒng)可以在每個反應中分析多達30個基因,; 可以對數(shù)萬個樣品的數(shù)十甚至數(shù)百個基因位點進行定量分析,這一能力是業(yè)界的任何其它方法所無法比擬的,。

2.敏感性高,,結(jié)果重復性好: GeXP系統(tǒng)克服了傳統(tǒng)PCR擴增方法的不均等擴增造成的偏差,提高了對一套目的基因進行定量的速度和敏感性,。

3.方法簡便,,使用經(jīng)濟:GeXP提供從試劑、多重PCR引物設計,、結(jié)果及定量表達譜分析等全套實驗方案,;GeXP內(nèi)在的多重分析能力可以使您在每個樣本花費極低的前提下,同時分析多達30個的基因,。

4.易于實現(xiàn)自動化:就樣品制備而言,,Biomek系列自動液體處理儀可以與GeXP分析儀和Ampligrid擴增儀完全匹配, 集成的條形碼閱讀器保證了準確的樣品追蹤和結(jié)果報告,。

GeXP系統(tǒng)是基因表達多重定量分析的準確,、經(jīng)濟、高通量的最新解決方案,,它能夠?qū)Χ嘀?/span>35重的目標基因的表達情況進行定量分析比較,是多重PCR領(lǐng)域的革命性技術(shù),。它巧妙的將多重PCR技術(shù)和毛細管電泳技術(shù)結(jié)合起來,,采用通用引物與特異引物相結(jié)合的方法,通過專利技術(shù)來實現(xiàn)多重PCR產(chǎn)物定量檢測的目的,。GeXP系統(tǒng)克服了芯片成本高,、重復性差和定量PCR方法通量低等弊端,是目前唯一可以進行低成本高效的多重PCR定量分析的技術(shù)平臺,。

二,、主要應用領(lǐng)域

(一) 臨床相關(guān)應用

1.肝癌單細胞診斷與用藥指導

結(jié)合高端分選型流式細胞儀Moflo,我們可以根據(jù)所拿到的血清腫瘤循環(huán)細胞進行單細胞PCR擴增后,,運用GeXP技術(shù)對腫瘤細胞進行遺傳學分析,,充分解析其表達及基因突變點,為臨床用藥指導提供幫助。鑒定癌良性腫瘤中有無惡變及其程度是實現(xiàn)正確有效干預的重要前提,。

2.肝癌表達譜分析(腫瘤標志物篩查)

3.乙肝病毒耐藥突變檢測

GeXP 在乙肝耐藥性檢測上,,相比ABI 所有型號機器都有優(yōu)勢:雜合子檢測能力(GeXP 可以檢測10%的雜合位點):乙肝患者服用藥物后,體內(nèi)病毒的突變是緩慢,,循序漸進的,,因此在每次檢測時候,某段序列不可能100%全部突變成另外一段序列,。如果能夠在病毒只有10%的耐藥性突變時,,調(diào)整給藥,將有利于及時控制病情,。

4.以DNA序列分析為基礎(chǔ)的應用

如病原體鑒定,、突變分析、耐藥變異分析等,。

5.以DNA片段分析為基礎(chǔ)的研究

SNP單堿基突變檢測,、STR個體識別親緣鑒定、腫瘤細胞雜合子缺失分析,、擴增片段長度多態(tài)性分析,、中藥指紋圖譜等。

(二)科研相關(guān)應用

1.單細胞測序

采用AmpliGrid技術(shù),,單細胞擴增和測序可以整合在同一個工作流程中,。PCR反應在單細胞被放置的位點進行,極大降低了污染的風險和測序噪音的產(chǎn)生,。

2.單細胞基因表達

單個細胞的多重基因表達能為研究者提供豐富的基因表達信息,, 在僅有一個獨特細胞的情況下,通過與Beckman CoulterGeXP多重基因表達系統(tǒng)的聯(lián)用,,能為研究者提供關(guān)于一個細胞的40個基因表達信息,。

3.單細胞拷貝數(shù)變異分析

AmpliGrid技術(shù)可以顯著地降低全基因組染色體缺失/存在分析的復雜度,用該方法檢測單細胞,,結(jié)合對多個遺傳位點的冗余分析,,使得染色體缺失/存在檢測更加準確。

4.整合免疫分型和單細胞基因表達分析

除了上述研究的功能之外,,GeXP既然被稱為“多功能基因分析系統(tǒng)”它自然囊括了目前幾乎各種基因分析的應用:

DNA的序列測定:可以實現(xiàn)800bpDNA的準確測序,,精確度高達98.5%

SNP多態(tài)性分析:可進行多至10重的SNP位點分型

STR多態(tài)性分析:可以進行人類STR位點的分析,即個體識別

AFLP多態(tài)性分析

HLA精細分型

基于STR分析的連鎖分析

基于測序和片段分析的病毒基因型鑒定和載量分析

基因靶點Biomarker的發(fā)現(xiàn)

與癌癥等疾病發(fā)生有關(guān)的geneset 確證

RNA干擾(RNA interference)研究

代謝途徑分析(PathwayAnalysis)

基因表達調(diào)控的監(jiān)測(MonitorGene Regulation)

藥物特征研究(DrugCharacterization)